پروتئوس از ۲ بخش Schematic Capture و PCB Layout تشکیل شده است. Schematic Capture محیطی برای ترسیم شماتیک مدار و شبیه‌سازی است و PCB Layout محیطی است که امکان طراحی برد مدار چاپی (PCB) را فراهم می‌کند.
محیط Schematic Capture طیف گسترده‌ای از قطعات را در کتابخانه خود دارد؛ از این قطعات می‌توان به منابع تغذیه، ابزار‌های اندازه‌گیری و تجزیه و تحلیل، انواع نمایشگرها، میکروکنترلرها و… اشاره کرد. همچنین امکان اضافه کردن قطعات به کتابخانه نیز وجود دارد. برای این کار کافی است کتابخانه قطعه یا قطعات مورد نیاز خود را از بخش library manager اضافه کنید.
از ویژگی‌های مهم Schematic Capture امکان شبیه‌سازی مدارها است که می‌توان برای شبیه‌سازی مدارهای آنالوگ، دیجیتال، میکروکنترلی و میکروپروسسوری از آن استفاده کرد. شبیه‌سازی توسط موتور قدرتمند SPICE صورت می‌گیرد و نتایج بدست آمده بسیار به واقعیت نزدیک است اما رقیب نرم‌ افزارهای OrCad و Advanced Design System نمی‌شود.